• Impulsar una permanente mejora de la formación profesional integral y pertinente con el desarrollo.

• Propiciar el posicionamiento nacional e internacional de la Institución.

• Mejora permanente de los procesos de enseñanza aprendizaje.

• Fortalecimiento de la investigación y de la innovación científica.

• Fortalecimiento de las actividades referidas a extensión universitaria y proyección social.

Se destacan las publicaciones que presentan informaciones actualizadas, adecuadas y fidedignas entre las que se destacan: Flujo de estudiantes en las Carreras, Autoridades, Mapas de ubicación, Planes de Estudios, Datos Estadísticos, Resultados de encuestas a egresados, Cursos de Post grados, entre otras.

A nivel del MERCOSUR, el Sector Educacional originado en el año 1.991 define prioridades por ende el Instituto Juan Pablo II en su Plan de Mejoras realizara convenios con Países de este bloque en el área de la salud, entre las que se destaca el funcionamiento del Mecanismo Experimental de Acreditación de carreras (MEXA) para el reconocimiento de títulos de grado universitario en los países del MERCOSUR, Bolivia y Chile.

Así como la Ley de la ANEAES en su Artículo 19 expresa que "La evaluación y acreditación abarcarán como mínimo los aspectos de la integridad institucional, las funciones de docencia, investigación y extensión y de la gestión institucional, así como los recursos humanos, físicos, económicos y financieros necesarios para otorgar los grados académicos y los títulos profesionales de que se trate", y con el Sistema Acreditación Regional de Carreras Universitarias Mercosur (ARCU-SUR) buscando el aseguramiento de la calidad, el Instituto Juan Pablo II participa en las (convocatorias de Evaluación para acreditación , diagnosticas en el modelo nacional y ARCU -SUR) .